En el Torneo Apertura 2013, el Atlético Marte realizó su mejor desempeño en los torneos cortos del fútbol salvadoreño, ya que lideró la tabla de clasificación al término de la primera fase, por lo que logró entrar a semifinales, algo que no había sucedido desde el Clausura 1999. Bajo la dirección del técnico nacional Guillermo Rivera, el equipo se mantuvo invicto hasta la penúltima jornada, ya que cayó derrotado ante la Universidad de El Salvador en la fecha final de las dos vueltas de clasificación. Al final del partido, los aficionados protestaron a una directiva presidida por Manuel Domínguez Platas. El 16 de julio de 2010, pocos días después, en el curso de este proceso judicial, el juzgado número 6 de Sevilla suspendió la venta del paquete de acciones a Bitton Sport, congeló el ejercicio de los derechos políticos del 51% de las acciones que poseía Farusa y le impuso una fianza a Lopera de 25 millones de euros. «El fichaje de Figo sólo costaría al Real Madrid 180 millones de pesetas». En la campaña 2006-07 el Real Betis hizo una pobre temporada, salvándose del descenso en la última jornada tras ganar por 0-2 al Racing de Santander en El Sardinero, con dos goles de Edu.
Una vez estabilizado en primera división logró formar, junto al secretario técnico de la entidad José María de la Concha, una plantilla destacada en la que figuraban jugadores históricos como Julio Cardeñosa, José Ramón Esnaola y el incipiente Rafael Gordillo uno de los mitos del club bético que debutó en 1977 y permaneció en él durante nueve temporadas en su primera etapa. En 2006 la temporada terminó con el equipo al borde del descenso en la liga. Con este, el equipo continuó su racha positiva y lentamente se asentó en las posiciones de ascenso directo. El ascenso de Huachipato y Green Cross de Temuco se hizo efectivo después del Torneo de Apertura de 1984; mientras que el de Wanderers fue inmediato. Ocupó este cargo cuatro partidos ante Llagostera, Mallorca, Lugo y Racing, pero los resultados obtenidos (4 victorias y, por ende, 12 puntos de 12 posibles) fueron vitales para que el equipo se acercase al objetivo de retornar a la máxima categoría del fútbol español, alcanzando la 3ª posición antes de las fechas navideñas. Dos días después, Velázquez fue destituido, dejando al equipo en sexta posición con 21 puntos tras 14 jornadas (6 victorias, 3 empates y 5 derrotas) y a 8 puntos del ascenso directo.
2005 fue uno de los años más brillantes del Betis, el club finalizó en una muy notable cuarta posición y se clasificó para jugar la previa de Liga de Campeones, y ganó la Copa del Rey de fútbol 2004-05 en el Vicente Calderón. En una entrevista, comentó que al querer entrevistar a Eduardo Manera (técnico de Estudiantes), «una turba de gente se metió a la cancha, me arrancaron el micrófono, auriculares, todo». La categoría comienza a funcionar en 1940. Hasta 1968 se trataba de la segunda categoría en tal ámbito hasta la creación de la Regional Preferente de Aragón, si bien, además hubo una etapa en los años 1970 que llegó a ser la cuarta categoría por la creación de la Segunda Regional Preferente de Aragón, división que no tuvo más existencia que la de, tan sólo, cinco temporadas. Se inició entonces una nueva etapa, con Luis Aloy en el banquillo, quien consiguió dos ascensos consecutivos, llevando el equipo a debutar en Segunda División. Tras perder contra el Fútbol Club Barcelona por 4-2, siendo el primer equipo que desde el verano, marcaba un gol al Barça, empata ante el Sevilla FC, en el derbi por 1-1 en el Benito Villamarín.
Se amplió el Estadio Benito Villamarín, con la construcción de las tribunas de gol norte, gol sur y el voladizo de preferencia. 2018-19 Valencia C. F. (8) 2 – 1 F. C. Barcelona Benito Villamarín, Sevilla Primera edición del torneo con uso del V.A.R. Se recurrió de forma provisional al técnico del equipo filial, Juan Merino, hasta que se concretase la firma de un nuevo entrenador. Se mantenía la formación de la bandera, pero de forma invertida (es decir: amarillo para medias, azul para pantalones y rojo para camiseta). Como curiosidad, cabe anotar que, pese a que la equipación del Nàstic es de color rojo, en la época franquista no se podía decir el equipo rojo de Tarragona ni nada similar, así que se le llamó equipo grana, y así ha continuado hasta nuestros días. Así las cosas, entre campeones y subcampeones del Campeonato de España, los participantes de la nueva Primera División sumaban un número impar, que habría de ser completado con uno de los clubes que hubieran sido campeones regionales sin haber alcanzado la final nacional.